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⚠ 履歴 — v0.28.1 リリースノート · ランク #6/12 正直版

v0.28.1 — 修正された σ-profile + 正直なベンチマークギャップの解消

3 つの正確性修正(電荷保存、NaN セーフなモーメント、セグメントセットフィルタ)に加え、3 つのベンチマークギャップフィールド(直接 DFT 双極子、バイアスシフト、5 パラメータトランスレータ)。FreeSolv ΔG 水和に対する正直な OOD:生 DFT + 普遍的な +0.51 バイアスシフトを用いて MAE 0.87 kcal/mol でランク #6/12。トランスレータの LOO MAE は 1.23(生の 0.945 より悪い)— 研究専用であり、本番向けではありません。⚠ 履歴:これは v0.28.1 リリース(2026 年 4 月)を記録したものです。現在の本番は v0.28.3 で、28 個の FreeSolv アンカーに対して MAE 0.85 kcal/mol、+1.71 バイアスシフト — PROJECT_SNAPSHOT と /benchmarks ページを参照してください。

正確性 — v0.28 の DFT 経路は、COSMO 電荷保存の再正規化が欠落していたため、HB ドナーを過小評価し、大きく柔軟なポリマーで分極を過大計上していました。v0.28.1 は、すべての本番 COSMO コードが用いる標準的な面積加重均一 σ シフトにより ∫σ·dA = −kεps · Q_solute を強制します。これは下流パイプラインが実際に保持するセグメントセット(完全な Lebedev グリッドではない)に対して適用されます。HB ドナー質量が回復し、全エントリで |ΣQ_seg| < 0.05 e となります。

ベンチマークギャップの解消 — すべての .mfsig.json に 5 つの追加フィールドが付与されるようになりました。本番推奨の ΔG 数値は g_polar_bias_corrected_kcal_mol(生 + 普遍的な +0.511 kcal/mol シフト)です — 18 アンカーで MAE 0.87、ランク #6/12。5 パラメータトランスレータ(g_total_kcal_mol_translator)は研究/SAR 向けに公開されていますが、未知の医薬品には推奨されません:その LOO MAE は 1.23(生の 0.945 より悪い)で、15 アンカーのキャリブレーションコホートに過適合するためです。多パラメータの ΔG 補正を信頼する前に、約 100 アンカーを超えるまで学習してください。Atlas χ 分布は物理的に意味を持つようになりました:範囲 [−0.01, +1.11]、平均 +0.22、χ 合格セル 27%(破損コホートの 92.5% は退化した σ-profile の産物でした)。

コホートカバレッジ + 既知の制限

20 / 20 の医薬品が 7/7 ゲートに合格。19 / 20 のポリマーが 7/7 ゲートに合格。HPMCAS_L(123 原子、def2-SVP)は mfsig_deferred_queue.jsonl にあり、Heavy-Track ティア(高メモリティアまたは CPU フォールバック)を待っています。HB 相関:donor↔HBD r=+0.65、acceptor↔HBA r=+0.72(合格)。既知の制限:(a) χ カーネルは絶対キャビティ面積上でほぼゼロの大きさを生成 — スクリーニング専用で、アンカーごとの K_chi 再フィットを待っています。(b) σ 不変量 T01(0.05 e のコホートゲートより厳格)は、大きなポリマー上でサイズスケーリングの電荷残差を示します(19 ポリマー中 8 が全合格)。LVPP に関する注記:当社は LVPP-DFT をグラウンドトゥルースとして扱いません — ジオメトリ、キャビティ構築の詳細、σ-moment のいずれも公開しておらず、最良の DFT 緩和を行ってもコホートの LVPP に対する r² = 0.20 です(数値的ではなく構造的。refs/BENCHMARK_AND_COMPETITORS.md §4 を参照)。MolForge コホートの .mfsig.json — DFT 緩和ジオメトリ、明示的なキャビティ + ビン境界、σ-moment、SHA-256 監査を備える — が再現可能な代替リファレンスです。

来歴 + σ キャッシュ検証

FreeSolv アンカーファイル:database.txt v0.52、SHA-256 プレフィックス 2d13f095713bc39b、639 エントリ。コホート一致:20 医薬品中 15(パラセタモール、ジアゼパム、アムロジピン、アトルバスタチン、水は v0.52 に存在せず)。フィット分割:12 学習 / 3 ホールドアウトテスト、シード固定。本番リファレンスに対する直接 σ キャッシュコサイン検証:カフェイン 0.86、ジアゼパム 0.95 — 修正された v028 σ-profile が本番と一致することの最も明確な直接確認。以前はこの指標は 0/87 ≥ 0.90 でした。