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リファレンスコホート

MolForge グラウンドトゥルース・コホート — 100 の再現可能な σ-profile

キャリブレーションベンチマークとして LVPP を置き換える、公開されたコホート。医薬品ごとに SMILES + DFT 最適化ジオメトリ + σ-profile + HB 分割 + σ-moment + .mfsig.json 監査証跡。

最も引用されている学術的 σ-profile リファレンスセット(LVPP)は σ-profile のみを提供します — ジオメトリなし、キャビティ構築パラメータなし、σ-moment なし、再現性メタデータなし。これを検証または拡張しようとする者は、すべてをゼロから再導出しなければなりません。これが、第三者による測定で下流相関が r² ≈ 0.20 を決して上回らない理由です。

MolForge グラウンドトゥルース・コホートはこれを解決します:完全なデータパックを .mfsig.json v2.0-apex に収めた 100 の医薬品様分子。SHA-256 監査。同一ハードウェア上で mol.recompute() によりビット再現可能。誰でも 1 回の pip install + 1 回のポッド実行でコホートを検証または拡張できます。

コホート構成

8 原子以下の小分子 10 個 + 芳香族単環 15 個 + 多環 10 個 + 医薬品骨格 25 個 + 処方上位 50 のうち 25 個 + COSMO-RS 溶媒の主力 15 個。いずれも重原子 50 個未満、電荷 = 0、RDKit でパース可能。

計算予算

100 医薬品のグラウンドトゥルース・コホートはビット再現可能で、医薬品ごとに署名され、Reference ティアでは Zenodo スタイルの DOI が付属します。同一ハードウェアを持つ誰もが全エントリを再検証できる、文献上初の σ-profile リファレンスデータセットです。