La qualité de la géométrie compte : le σ-profile est une empreinte de la surface réelle de la molécule, et la surface dépend de l'emplacement des atomes. Les géométries de niveau Reference sont minimisées jusqu'à ce que la norme du gradient résiduel passe sous 10⁻³ Hartree/Bohr — le seuil au-delà duquel les valeurs du σ-profile cessent de dériver à la précision machine.

Niveau 2 — xtb_relax=True (Industrial, prévu) : gradient analytique GFN2-xTB + scipy. Inférieur à la seconde par médicament. Pour le criblage à haut débit où une géométrie DFT serait superflue.

Convergence

Chaque .mfsig.json consigne la géométrie optimisée, la norme de gradient convergée, le nombre d'étapes d'optimisation, la méthodologie utilisée et le SHA-256 de l'état canonique. Les relances sur le même matériel reproduisent une sortie bit à bit identique.

Quand cela aide

La qualité de la géométrie compte le plus pour les structures flexibles où le σ-profile dépend des torsions et des dièdres. Pour les aromatiques rigides, cela compte moins, mais le niveau Platinum livre une géométrie de qualité Platinum sur chaque médicament — aucune décision par molécule pour le client.