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cohorte de referencia

Cohorte de referencia MolForge — 100 σ-profiles reproducibles

Una cohorte publicada que reemplaza a LVPP como benchmark de calibración. SMILES + geometría optimizada con DFT + σ-profile + división HB + momentos σ + traza de auditoría .mfsig.json por fármaco.

El conjunto de referencia de σ-profiles académico más citado (LVPP) entrega únicamente el σ-profile: sin geometrías, sin parámetros de construcción de la cavidad, sin momentos σ, sin metadatos de reproducibilidad. Cualquiera que intente verificarlo o ampliarlo tiene que rederivar todo desde cero, por lo que la correlación aguas abajo frente a él nunca es superior a r² ≈ 0,20 en mediciones de terceros.

La cohorte de referencia MolForge resuelve esto: 100 moléculas similares a fármacos con el paquete de datos completo en .mfsig.json v2.0-apex. Auditoría SHA-256. Reproducible bit a bit mediante mol.recompute() en el mismo hardware. Cualquiera puede verificar o ampliar la cohorte con un pip install + una ejecución en pod.

Composición de la cohorte

10 moléculas pequeñas ≤ 8 átomos + 15 monocíclicas aromáticas + 10 policíclicas + 25 esqueletos de fármacos + 25 de los 50 más recetados + 15 disolventes caballo de batalla de COSMO-RS. < 50 átomos pesados cada una, carga = 0, analizables con RDKit.

Presupuesto de cómputo

La cohorte de referencia de 100 fármacos es reproducible bit a bit, firmada por fármaco y se entrega con un DOI estilo Zenodo en el nivel Reference. El primer conjunto de datos de referencia de σ-profiles en la literatura donde cualquiera con el mismo hardware puede reverificar cada entrada.