La calidad de la geometría importa: el σ-profile es una huella de la superficie real de la molécula, y la superficie depende de dónde están los átomos. Las geometrías de nivel Reference se minimizan hasta que la norma del gradiente residual cae por debajo de 10⁻³ Hartree/Bohr, el umbral más allá del cual los valores del σ-profile dejan de derivar a precisión de máquina.

Nivel 2 — xtb_relax=True (Industrial, previsto): gradiente analítico GFN2-xTB + scipy. Menos de un segundo por fármaco. Para cribado de alto rendimiento donde la geometría DFT sería excesiva.

Convergencia

Cada .mfsig.json registra la geometría optimizada, la norma del gradiente convergido, el número de pasos de optimización, la metodología utilizada y el SHA-256 del estado canónico. Las reejecuciones en el mismo hardware reproducen una salida bit a bit idéntica.

Cuándo ayuda

La calidad de la geometría importa más en esqueletos flexibles donde el σ-profile depende de torsiones y diedros. Para aromáticos rígidos importa menos, pero el nivel Platinum entrega geometría de grado Platinum en cada fármaco, sin decisiones por molécula para el cliente.